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与会者认为，党的十六届五中全会在“十一五”规划《建议》中提出增强自主创新能力作为国家战略，是事关我国改革发展全局的重大战略举措，也是落实科学发展观、促进经济增长方式根本转变的必然选择。我国要解决经济社会发展中存在的突出问题，在复杂的国际竞争中赢得优势，就必须把增强自主创新能力作为科学技术发展的战略基点和调整经济结构、转变经济增长方式的中心环节，开拓出一条具有中国特色的自主创新之路，建设创新型国家。自主创新能力不强是广东经济发展的致命弱点，广东要增创新优势、实现新发展，根本出路也在于提高自主创新能力，推动经济增长方式从要素驱动型向创新驱动型转变。
与会者强调，自主创新不能囿于技术创新，文化创新、制度创新和思维方式创新是实现自主创新的重要支撑和保证。繁荣发展哲学社会科学，积极推动理论创新，是增强自主创新能力的重要环节。当前需要着重深化以下方面问题的研究:关于增强自主创新能力与落实科学发展观、构建和谐社会的关系；关于自主创新能力的内涵、评价标准和指标体系；关于国外增强自主创新能力的做法和经验；关于我国及广东自主创新能力的现状，增强自主创新能力的战略选择和政策思路；关于科技成果转化的实现机制和有效途径；关于自主创新能力的培育与创新文化建设。